1935年到1936年間，侵華日軍根據天皇裕仁的密令，在中國東北建立了兩支秘密細菌部隊，其中之一就是由石井四郎主持的“關東軍防疫給水部”，後改稱“第731部隊”。該部隊駐在哈爾濱南部平房一帶，占地達三十多平方公裏，為了對外保密，掩蓋罪惡，僅參加修建四方樓細菌實驗工廠的三千多名中國勞工就被全部秘密殺害。這支部隊擁有細菌專家、科技人員三千餘名，並有自己專用的航空隊，還在海拉爾、孫吳、牡丹江、林口建立了四個支隊。資料記載，這支部隊培養的細菌有鼠疫、霍亂、壞疽、炭疽、傷寒、副傷寒等。在一個生產周期內，即能生產不下三萬萬億微生物，每月能培製出三百公斤鼠疫菌及數千萬隻專門用作傳播細菌的跳蚤。他們先是用動物做實驗，後來建了可容三四百人的秘密監獄，抓來中國的抗日愛國誌士、無辜群眾和蘇聯、蒙古、朝鮮人，用他們做活人試驗，進行活體解剖。原731部隊細菌生產部長川島清在伯力軍事法庭上曾經供認：“731部隊在平房五年時間內，通過這個工廠，因染受致命細菌而被消滅的至少有三千人。”日本侵略者不僅大規模製造細菌武器，而且公然違反國際法，在侵華戰爭中大量使用細菌武器，給中國人民帶來深重的災難，他們犯下了不可饒恕的罪行。
細菌試驗、活體解剖、凍傷試驗部分揭露了731部隊進行的各種細菌試驗。細菌試驗的主要方法是用注射器將細菌注入人體肌肉之後，觀察病變反映，還有強行灌菌試驗。起初，他們將各種細菌摻入飯菜、水果、飲水裏，誘騙被實驗者食用。當這種手段被識破後，他們便把人綁上強行灌注。731部隊研究人員山下升後來供述，從1944年8月到1945年5月的九個月時間，他親手用飲水灌菌一百九十多人，都死掉了。最殘忍的試驗是活體解剖。活人被試驗後，大多被直接扔進焚屍爐。從人體上切割下來的部分經病理研究後被送進標本陳列室。還有非常殘酷的凍傷試驗，他們強迫被實驗者在嚴寒的冬季裸露身體或僅穿單衣到室外接受冷凍。如果是夏季，就把人趕入冷凍室冷凍。當冷凍達到所需程度後，就把人拖到實驗室試驗解凍方法。或用冷水澆，或用溫水澆，甚至用滾開的熱水燙，以求最佳解凍方法。有的被實驗者在極度痛苦中當場死掉，有的爛掉皮肉露出白骨。
部分被害者的遺照和大量案例及文獻資料證實，許多國際反帝情報組織成員及反滿抗日分子被捕後，被用特別輸送手段送往731部隊，慘遭各種試驗最後被殺害的事實。
細菌生產、細菌武器、野外試驗資料部分證實，731部隊如果開動所有設備，每月可生產鼠疫菌三百公斤，或者霍亂菌七百公斤；731部隊對各種細菌武器的製造和貯藏都作了精心研究和準備，他們為專門從事間諜、暗殺行動的日軍人員特製了毒彈頭，並研製出手槍式、鋼筆式、玩具式小型細菌武器；731部隊為了達到最終使用細菌武器的目的，不僅在室內而且還在野外頻繁進行實驗。他們在野外實驗場，把人綁在立柱上，間隔一定距離爆破細菌彈。被彈片打中的試驗對象，如果沒死還要繼續當試驗品使用，直至其斷氣為止。
細菌戰資料部分提供了細菌武器研製成功後日軍將其用於戰爭的證據。1940年7月，石井率一支航空隊，在浙江寧波地區用飛機將七十公斤傷寒菌、五十公斤霍亂菌和五公斤染有鼠疫菌的跳蚤，散布在蓄水池和居民區，使寧波一帶發生了鼠疫等惡性傳染病。1942年7、8月間，731部隊又派出遠征隊到南京，在另一支侵華部隊配合下，在重慶和浙贛鐵路沿線，用飛機把一百三十公斤的炭疽熱菌、副傷寒菌和鼠疫菌投擲到水渠、沼澤地及住宅區，致使這些地方陸續發生大範圍疫病，造成大批平民染病痛苦死亡。
毀滅罪證資料部分反映了石井一夥戰敗潰逃時的情景。1945年春夏，石井為掩蓋滔天罪行決定炸毀設施，銷毀罪證，同時下令將獄中監押的最後四百餘名待實驗人員用毒氣一次性全部殺死，隨後將屍體拖出，扔進事先挖好的八個大坑內，澆上汽油焚燒，燒剩的屍骨有的就地掩埋，有的裝入麻袋內運至鬆花江邊拋入江中。他們將凡是能證明其罪行的文件資料全部燒毀，而將那些用活人做細菌試驗取得的絕密資料都帶著逃回日本。
簡評：
據後來731部隊的一個日本人交待，從1945年3月起，731部隊開展了決戰前的細菌增產運動，儲存了大量細菌，如果他們的計劃和方法得以實現，可以滅絕地球上的人類。然而，蘇聯紅軍和東北抗聯對日本關東軍迅速有力的打擊，粉碎了侵華日軍的罪惡陰謀。
侵華日軍731細菌部隊陳列館向世人展示侵華日軍在中國的一樁樁、一件件法西斯暴行，世界人民不會忘記，中國人民更是永遠不會忘記！