李天華轉而重點調查河南都司都指使覃恩成。
都指揮使是本朝“都指揮使司”的一把手，“都指揮使司”在明初期是省級長官，他的職責是管理省內衛所兵的後勤保障，日常訓練等等事宜。都指揮使司隸屬於五軍都督府，聽命於兵部，河南都司歸中軍都督府管轄。
總兵則是在戰時由中央下派到戰區指揮作戰的總指揮。下派的總兵掛將軍印兼領總兵官，戰爭狀態結束後回中央，一般由勳貴或地方都督充任，他是一個職責稱謂，並沒有品級。
戰爭狀態下，他的排兵布陣則是通過地方的都指揮使司來實現。可以說，在本朝初期，戰時狀態下，都指揮使聽命於總兵，但在條線上並沒有直接的從屬，因為總兵沒有對都指揮使的人事權及獎懲權。
總兵官成為鎮守地方的最高軍事長官後，改變了練兵將領不指揮作戰，指揮作戰的將領不管練兵的問題，有利提高軍隊的戰鬥力，形成事權專一的局麵，但也存在著總兵稱霸一方、擁兵自重的可能。
為維護中央集權，再有戰爭時，朝廷又要往下派員，稱為巡撫，參與軍隊管理，削弱總兵官的權力。開始巡撫隻為臨時性的工作，後來才成定職，常駐地方。這樣一來，不僅原來的都指揮使司、布政使司、按察使司要受其節製，就連總兵官也要聽其指揮。
不過覃恩成的情況有些特別，他們家幾代為官，都任職都指揮使，又與周王府關係密切，所以隻手遮天，幾任總兵，都讓他們擠得沒地方站，指揮不了兵，任免不了將，在河南衛、弘農衛、陳州衛、睢陽衛、宣武衛、信陽衛、彰德衛、南陽衛、懷慶衛、潁川衛、南陽中護衛，汝州衛十二個衛中，衛指揮使大多出自他的門生故吏，張續我名義上掌握了兵權，沒有他的點頭，很難指揮這些兵馬，這種情況，在大明十六個都司中，都相當少見。
李天華第一個拿的就是這位名震一方的都司指揮使，不過他又放了幾天，晾他幾天再審，覃恩成表現得相當冷靜，也沒有主使他手下的家丁們鬧事。
覃恩成手下可是有一千家丁，比之許多邊關大將，都毫不遜色。
李天華親自問話：“黃河缺口後，覃大人在幹什麼？”
覃恩成道：“本官知道黃河決口後，由張社保總兵率領河南中衛所、右衛所的人前去河堤上搶險，本官則率領另外三衛所和家丁尋找船隻，前往決口的柳園口下遊河段救人，當晚，事發突然，本官隻是找到了一百多艘小船，加之河水又大又急，救的人有限，直至張大人他們堵住了決口後，情況才有所改觀。”
李天華道：“也就是說，河防營屬於你部搜救的區域？”
覃恩成道：“是的。”
李天華道：“在搜救的過程中，你們救了多少河防營的人？”
覃恩成道：“沒有！”
李天華道：“醜中決口，你們是什麼時侯才出發救人？”
覃恩成道：“集結部隊，搜尋船隻需要時間，我們在辰初（早上七點）出發，也就是兩個半時辰後。”
李天華道：“也是堵住決口後的一個時辰後，你們有沒有發現什麼異常？”
覃恩成道：“有人，河防營沒有活口，這不常見，應該有人逃出生天才對，而且過半的死者身上有刀傷，腹中無水，可以斷定是被人殺死的。”
李天華道：“現在廠衛找到二千五百三十六具河防營士兵的屍體，其中一千四百三十六具是溺死的，一千一百具死於刀劍，可以斷定，在醜中至辰初的兩個半時辰中，有人襲擊了河防營，在你們的眼皮子底下，覃大人認為是誰幹的？”
覃恩成道：“本官不知，當時決堤，水流湍急，本官手中船隻不足，並不敢貿然出手。”
李天華道：“在如此惡劣的環境下出擊，應該是訓練有素的精銳，人數不會低於二千，覃大人久掌河南，是不折不扣的地頭蛇，你知道有誰可以做到？”
覃恩成道：“本官不敢妄自猜測。”這裏麵水極深，他怎麼敢亂說話？
李天華道：“你不敢猜，本官就猜一猜吧？福王、周王、張巡撫、張總兵、還有覃大人你。”
覃恩成嚇了一大跳，說道：“大人慎言。”
李天華道：“本官在大膽假設，小心求證，不管幕後黑手是誰，一定會揪出來，繩之於法，為兄弟們報仇。”