數萬億紀元前，一對男女突然來到這個即將湮滅的小宇宙，兩人施展大神通，將小宇宙從新改造，並將其分隔成了九個相連的世界，這就是後世廣為相傳的九界。
時光流轉，在兩人的有意無意中，世間出現了萬物生靈，各種生靈循著正常或異常的道路，在九大世界中自然進化。
世間萬物，除了飛禽走獸外，出現了被稱之為萬靈之長的擁有智慧與情感的物種，這種物種極為接近創世之聖神，但隨著九大世界各自進化道路的不同，這些物種又分成了數百種不同的種族。
隨著進化的程度不同，種族的能力大小也不同，這些不同的種族為各種利益相互攻伐。經過數億年後，數百種族消失殆盡，隻剩下一些超級強勢的種族延續至今。
其中神族，魔族，鬼族，龍族，血族，人族，天使族，精靈族，矮人族，泰坦族，獸族，妖族，海族的數量和勢力都無比強大，他們霸著九界，相互製約。
千萬年後，九道流光從創世聖山中飛出，分別注入九個世界中去，這九道流光就是後世稱之為創世晶石的神晶。
得到九個神晶的九個種族，進化道路得到改善，生命力更為強大，各種武技魔法技術也日益精進，逐漸走向了繁榮昌盛，成為了九大世界的霸主。
因霸主種族的出現，九界因此得名，後世稱之為神界、鬼界、妖界、魔界、人界、靈界、聖界、幻界、無界。
各大霸主種族都不滿足於現狀，因此每隔數百年都會爆發世界大戰。
億萬年後，無界突然出現一場原因不明的爆炸，整個無界都陷入了一片災難，無界的神晶也因此落入人界。
各界霸主種族的首領連同精英族人紛紛前往無界調查真相，在獻出無比慘重的代價後，無名爆炸事件得以平息，各族之間對此守口如瓶，他們約定不能將殘酷的真相告知世人，每一代首領隻能讓一個人保留這個與創世之聖神有關的秘密真相。
但創世之聖神所遺留下的三本書內記載了秘密真相，為了防止真相外泄，各族首領將三書各分上中下三卷，分別藏於九大世界各地。
為向世人解釋，各族將無名爆炸事件稱之為神魔大戰。
同時九大神晶隻要有一塊受損，這個世界將會毀滅的傳說開始流傳。
然後，無界入口被超級聖結界封印，同時無界內出現與世隔離的失落之都。
隨著時光的流逝，數百萬年後的某年，各霸主種族首領盡皆因不明原因暴斃，秘密真相終至失傳，三書所藏位置也不為人知。
如今，曆經數萬紀元遺失真相的滄海桑田，曆史的殘酷真相卻將被再次揭開，而命運的目光卻停留在一個少年身上。