木葉四十八年，這個新年對許多家庭來說都充滿陰霾，因為砂隱和木葉的大戰波及到了更多的忍村和國家，倒是雨之國因為曉組織的震懾迎來短暫的和平。
就連幾大國也不想這時再招惹曉組織，把人家逼到木葉的戰壕裏去。大野木也決定先夥同雷影對付木葉。
水門帶著三代目風影和赤砂之蠍的屍體來到了川之國前線與砂隱對峙，揭露風影被暗殺的真相，與砂隱展開了曠日持久的停戰談判。
可是這時岩隱和雲隱部隊分別從草之國和湯之國過境，攻入了火之國的腹地，以摧枯拉朽之勢推進到桔梗山城堡附近，大有聯手宰割木葉的意思。
就連海外的霧忍也派出忍刀七人眾帶隊登陸火之國，想要渾水摸魚。
這時，藥師野乃宇已經離開木葉醫院，在桔梗山的戰地醫院工作。一日，她奉命參加一個小隊，趕到遠處一個山村，救治山洞裏避難的村民。
忽然，有岩隱忍者突襲，大家被迫帶著村民們躲入岩洞深處。小隊的其他忍者被敵人拖住，生死不知。
岩洞中發生多處坍塌，藥師野乃宇和其他人走散了，身邊隻有一個四五歲的失憶孤兒。
她也搞不清自己的位置，能找到的出路似乎都被塌方堵住了，她沒有土遁忍術的才能，根本無法脫身，眼看就要被困死在洞裏。
野乃宇坐在冰冷的石壁上，抱著被她取名為兜的懵懂男孩，猶豫著吃下最後一顆兵糧丸，終於想起什麼，從忍具包裏摸出一張奇怪的符咒，上麵有一個傳字。
她向其中輸入查克拉，符咒似乎發出了一陣微光，照亮了漆黑的山洞，但是很快又隱沒下去。就這樣，她時不時地激活符咒，滿懷希望地祈禱著。
與此同時，遠在重吾道場的張彥感到傳訊符震動，取出激活，隻見符籙背麵顯出一個“藥”字。原來是藥師野乃宇的符咒。
張彥沉吟了一會，讓小南叫大家收拾出發。經過幾個挪移，來到木葉邊境附近，一處他曾設置挪移符陣的地方，感知到求救的符咒還在木葉腹地。
他展開飛舟符，和小南一起向遠處趕去。
同一時間，雨隱村的醫館中，漩渦香蒲從手術室走出，疲憊地回到辦公室，捏著僵硬的脖子，身後角落忽然有人現身，一記手刀把她打暈帶走。
長門到晚上才發現香蒲失蹤，原地有一封信，讓他找木葉贖人。他連忙用傳訊符向張彥求救。這時，張彥才剛剛趕到藥師野乃宇所在的山洞。
他感應了一下留在香蒲體內的定位符，發現正在火之國境內移動，便猜到自己中了調虎離山之計，於是讓長門先往火之國的方向追蹤，自己隨後就到。
由於玉石之類在五行中屬金，張彥和小南拿出一批金係符籙，移開坍塌的岩石。
眼見符籙用完，野乃宇還在岩體更深處，於是又畫出幾張金遁符，拍在自己和小南的身上。
兩人如有穿牆術一般，直接融入岩石當中，向野乃宇所在處遁去，過了一會終於找到了因饑渴而昏迷的兩人，把他們收入小洞天符中，再抓緊去追香蒲。
另一邊，暴怒的長門終於追上，發現是一幫流浪忍者接了賞金任務來綁架香蒲。這時香蒲好像恢複了意識，突然出手製服了挾持她的忍者。
長門瞬身上前接應她，不料香蒲突然掏出苦無劃向長門的喉嚨。千鈞一發之際，香蒲咬破自己的舌頭，暫時清醒過來，用苦無插進自己胸口。
長門才發現香蒲被人控製了。看到伊人嘴角溢血軟倒在地，長門仰天長嘯，眼中三顆勾玉飛速旋轉，化為一個黑紅相間的螺旋，由五條紋路盤旋彙聚而成。
同時一個半身的紫色骷髏巨人包裹住兩人，掄起雙拳砸扁了一眾流浪忍者。
就在長門因強行動用須佐能乎而視線模糊，頭腦昏沉的時候，倒地的香蒲被黑色液體包裹，滲入了地底，很快便消失不見。
張彥和小南趕到的時候，就看到長門癱坐在幾塊肉泥之間，睜著萬花筒寫輪眼，呆呆的望著天空。
張彥感應了一下，拍拍他肩膀說：“別太擔心了，香蒲被帶進木葉了，應該是團藏那家夥需要通過她掌握輪回眼。我馬上想辦法救她，保證還你一個完好的香蒲。”
小南也在一旁安慰道：“她的性命應該還好，對那些人而言，她活著才有用。至於其他的小手段，找回她以後，相信彌彥哥總能解決的。”