【元病毒】
與此同時，撤離到“方舟”基地的全球衛生組織，終於在病毒的研究上取得了突破。 一次偶然的機會，首例病毒發現者維基·周醫生，發現病毒會對一種波產生回應。
通過不斷對波段模擬和檢測，衛生組織找到了四個共鳴最強烈的點，分別處於南印洲、西陸平原、北陸高地和舊海。病毒研究小組大膽推測，這四個共鳴點具有影響其他地區病毒的能力，因此將它們稱為“元病毒 (母體)"。維基·周和一些學者認為，摧毀元病毒能夠遏製病毒的能力，這是人類重建文明的新希望。
【摧毀元病毒】
然而，曆經多次失敗嚐試的共治政府，對維基·周他們的推測抱有懷疑，並認為不應該把方舟的軍事力量浪費在一個猜測的結論上，保護方舟的安全是現階段的首要目標。共治政府消極、保守的態度讓維基周十分失望。他離開了基地，並於幾個月之後出現在秋山真之麵前，沒有人知道他是如何穿過感染者遍布的曠野，來到這個北陸帝國的。
而此時的秋山真之，已吸收了北陸高原所有的避難所，並占領了被遺棄的軍事基地，定都於捷卡德琳堡。 秋山真之對維基·周的推測也抱有懷疑態度，但不同的是，他願意賭一把。
幾周後，秋山真之啟動了軍事基地，並向南印洲的元病毒 (母體)定位地點發射了一顆原子彈。劇烈的爆炸後，轟炸點出現了激烈的震蕩，然後如同深淵般的巨大裂縫撕裂了大地，橫亙在南印洲的土地上。隨後幾周，觀測點返回的數據表明南印洲感染者活躍程度明顯下降，且沒有新的特殊變異體出現。
事實證明，維基·周和秋山真之賭贏了。隨後，秋山真之又將僅剩的兩顆原子彈投向了北陸的嚎風隘口，還有舊海，穩固了周邊的安全。就在西陸平原的難民感到被世界徹底遺棄的時候，方舟基地向西陸平原元病毒定位點發射了原子彈。
【舊世界與新世界】
紀曆1073年12月12日
元病毒被摧毀，這一天被人們稱為“拯救日”，也是劃分“新舊世界”的分割點。舊大陸的人們，終於迎來了新的希望。而秋山真之摧毀元病毒的行為，也被遺棄在舊大陸的 人視為救世主。大批避難所都希望加入秋山真之的陣營。
消息很快傳遍了整個大陸，人們歡呼雀躍，慶祝這個曆史性的時刻。各大勢力也開始重新審視自己的戰略和計劃。
秋山真之的名聲迅速傳播開來，他的勢力範圍不斷擴大，吸引了更多的幸存者加入。他利用廢棄的資源和科技，努力恢複社會秩序，建立起一個相對穩定的帝國。
然而，病毒的威脅並沒有完全消除。雖然元病毒已被摧毀，但其他變異病毒依然存在，隨時可能引發新的危機。幸存者們必須保持警惕，繼續與病毒作鬥爭。
在這個充滿挑戰和機遇的新世界中，秋山真之和他的追隨者們麵臨著重重困難。但他們堅信，隻要團結一心，就一定能夠創造出更加美好的未來。