清軍陣亡521人，傷150人，下落不明者51人，軍艦被擊沉9艘，傷2艘，被毀兵船十餘艘。
此役中，詹天佑的同學，我國派出的首批留美幼童中的四名陣亡，其中三名是麻省理工學院畢業後在福建水師服役。
馬江海戰之後，朝廷命建昭忠祠，中祀栗主12，東西配饗各24人，均艦上弁目及練童、醫生等，兩廡祀陣亡兵士736人，船政大臣裴蔭森製文立碑，以慰忠魂而垂不朽。
陣亡將士姓名附下：
“飛雲”督帶總兵銜準補廣東平海營參將高騰雲
“福勝”、“建勝”督帶蘭翎參將銜補用遊擊盡先都司呂瀚
“福星”管駕都司銜五品軍功陳英
“振威”管駕都司銜留閩盡先守備許壽山
“福勝”管駕都司銜留閩補用守備盡先千總葉琛
“建勝”管駕都司銜五品軍功林森林
“揚武”兵船副管駕花翎都司銜升用守備盡先千總梁梓芳
平海左營三號師船管駕藍翎留閩盡先補用都司蔡福安
平海左營一號師船管駕藍翎盡先補用都司蔡接
平海左營四號師船管駕藍翎盡先補用守備張啟
鎮海右營漁船管駕閩浙督標守備銜盡先千總李來生
閩四師船管駕閩安左營千總陳猛
“建威”大副六品軍功陳善元
“飛雲”大副六品軍功盡先拔補外委謝潤德
“建勝”大副六品軍功補用把總丁兆中
“振威”大副六品軍功梁祖勳
“揚武”二副五品軍功林鵬
“福星”二副六品軍功張春
“振威”二副六品軍功鄺詠鍾
“飛雲”正管輪五品軍功潘錫基
“振威”正管輪都司銜水師提標盡先守備林維三
“福勝”正管輪七品軍功任三穆
“建勝”正管輪五品軍功陸崇業
“福星”副管輪五品軍功補用把總盡先外委陳士秀
“福勝”副管輪七品軍功戴慶濤
“建勝”副管輪六品軍功從九職銜鄭守三
“揚武”三管輪七品軍功龐廷楨
“振威”三副五品軍功邱芳泉
“濟安”醫生吳進階
“建勝”學習管輪學生陳錦超
“濟安”管炮六品軍功梁琛
寧船三號隊長黃得才
寧船三號隊長黃有福
寧船三號隊目王益年
平海左營一號師船司事五品藍翎侯選州吏目林榮光
平海左營二號師船司事五品軍功盡先外委廣東平連
學武生胡定魁
平海左營四號師船司事盡先都司倪竹虛
寧船三號總頭目長樂學武生鄭景濤
“揚武”正管隊五品軍功鄭葆辰
“揚武”副管隊藍翎閩浙督標水師盡先補用守備郭玉麟
“揚武”管炮正頭目六品軍功張湧泉
“揚武”留美回國練生六品軍功楊兆楠
“揚武”留美回國練生六品軍功薛有福
“揚武”留美回國練生七品軍功黃季良
“飛雲”三管輪五品軍功馬應波
“福星”三副五品軍功王漣
“福星”三管輪六品軍功陳常籌
“福勝”大副五品軍功翁守正（原名守恭）
“建勝”管炮六品軍功江鴻珍
“揚武”水手正頭目餘懷
“揚武”水手副頭目楊保
“飛雲”水手頭目六品軍功劉就
“福星”水手頭目黃良慶
“福勝”水手頭目楊昌勝
“福勝”升火頭目任阿煥
“建勝”升火頭目鄭德春
福靖老後營差弁花翎遊擊銜盡先補用都司胡鳥式翼
看管塢口差弁世襲雲騎尉候選守備陳俊
“建勝”炮船升火從九職銜李紹芬
“揚武”水手副頭目楊寶
“揚武”練生楊紹廣
平海左營一號師船炮手五品軍功從九職銜蔡五塤
平海左營一號炮手六品軍功張林
平海左營一號炮手盡先把總殷明恒
“揚武”
管水缸林奇山，管水汽表陳仁圖，號手吳進福，鼓手黃扶，舵工邱濟、陳裘、陳三、陳承、歐模、孟長雅，水手洪來、林鼎、林儔、朱必、洪集、吳聘、陳勝、林金釗、翁從、黃化、李燦、林實、林魁、黃安、龐翰、吳百達、郭灶、何洪寬、林長安、邱永豐、徐發、洪同，炮勇周世源、張祝、謝恒升