依舊是紛亂嘈雜的現代化城市，與祈所在的世界的發展程度相差無幾。然而，這裏卻充斥著一種以人類為食的怪物——喰種！在這個世界，喰種是人見人憎的過街老鼠，不，過街老鼠的地位都比喰種高。
人類仇視喰種，喰種以人類為食，這是不知何時開始的。
喰種的外表與普通人類幾乎沒有任何差異，除了擁有一雙瞳孔是血紅色，眼白是黑色的赫子眼外。端坐在食物金字塔頂端的人類怎麼可能容忍喰種這樣的存在？
於是，專門獵殺喰種的機構便應運而生，ccg便是日本喰種對策局的簡稱。裏麵的搜查官按實力、資曆分為特等搜查官、準特等搜查官、上等搜查官、一等、二等、三等。
眨眼間，祈就突然來到了這個遍布危險的東京吃貨聚集地。而且，祈現在所要麵對的，是不知名喰種進食後的爛攤子。
地上有一具屍體，屍體缺了部分器官、疑似被啃食掉。殘肢被隨地亂扔，血漿、腦漿像澆花一樣灑在地上，紅的發紫。
“可惡！那些該死的怪物！”祈旁邊站立著一個中年大叔，手中提著一個銀色箱子。
“木暮前輩，我們來遲了。”祈還沒搞清楚當前到底是什麼情況，自己就已經自動把話說出口了。
怎麼回事？到底發生了什麼了？
祈迷茫地看著自己右手的銀色箱子，大腦當機了很久。傻站著許久後，祈才慢慢反應過來。
情況跟當初學園默示錄的一模一樣，東京喰種世界中也生活著一個祈。
在接收了這個身軀的同時，祈也把這個身體的記憶一並接收過來。在東京喰種世界中，祈是一個孤兒，雙親均被喰種殺害。後來，祈被ccg學院收留，成為了一名搜查官預備員。
今年，祈剛剛畢業，是一名初出茅廬的新人二等搜查官。
為了降低新人的陣亡率，ccg總局采取一老帶一嫩的政策。幫帶祈的中年人是一名上等搜查官，木暮上等。
“祈二等，通知分部派人來收拾。”木暮上等氣衝衝地喊道，語氣很不耐煩。
在接收的記憶中，祈得知木暮上等是一個關心後輩、善解人意的好前輩。大概是在懊惱自己來遲一步，救不了無辜被殺的人吧，所以木暮上等才會如此生氣。
祈拿出手機，生疏地打開通訊錄，找了一會才找到正確的號碼，撥打過去請求事後收拾。
木暮上等看了看祈，以為祈是看不慣這種血腥的場麵，所以也沒有多說什麼，自顧自地查看現場留下的信息。
祈望著專心致誌的木暮上等，在不驚擾木暮上等的前提下，悄悄來到陽台，呼吸一口新鮮空氣。
我剛才應該是跟小雪和紫雨在一起才對的，為什麼突然間就穿越到這個世界了？上一次到別的世界，還是在昂的帶領下才去成的。可是，昂當時也不在場啊？好奇怪。
更令祈百思不得其解的是，這個世界也生活著一個祈，同學園默示錄一模一樣。這到底意味著什麼，祈不得而知。