亞齊的獨立運動隨著“亞獨”組織領導的武裝力量不斷地取得勝利在亞齊地區是越演越烈，這裏麵也有衛華不斷加大對“亞獨”組織支持的結果。到八月底，衛華就不得不免費向亞獨組織提供包括地對空導彈在內的重武器，以抵抗印尼軍隊對“亞獨”武裝力量的圍剿，印尼的軍事實力還是比較強大的，遠不是一個小小的“亞獨”組織能抵抗得了的，如果衛華不向“亞獨”組織提供援助，“亞獨”組織根本就抵抗不了多長時間，衛華為了讓“亞獨”組織多存在一段時間，不得不把自己的生化戰士抽調一部分，暗中替“亞獨”組織解決了不少的問題。衛華對印尼的軍事力量還是很了解的，印尼華人抵抗組織也花費了很大的力氣對印尼軍隊的情況進行了解，但是衛華腦袋裏的聯絡器裏的資料更加的詳細。
印尼的軍事力量由海、陸、空三部分組成，陸軍除了負責陸地作戰外，還負責空中支援和海上運輸任務。為此，印尼陸軍承擔著管理、維護飛機和後勤登陸艇的任務。由於其本國特殊的島嶼地理條件，印尼的作戰編隊由三個地區性的基礎指揮部共同組成一個中央控製的機動部隊。這三個指揮部分別是：戰略預備部隊、十個軍事司令部以及特種部隊。這十個軍事地區司令部又被劃分為一係列較小的行政單位，包括軍事要塞司令部、軍區司令部和軍分區司令部。
每個軍事要塞司令部至少控製著一個或多個軍事司令部直屬地營級部隊。陸軍條令對戰術營和領地營作了區分。戰術營由戰略預備部隊組建。每個軍事司令部至少配備一個營級快速反應部隊。領地營是十個軍事司令部部隊的主要組成部分，每個營大約有七百名士兵。這些部隊地部分還時常被指派到戰略預備部隊和特種部隊執行任務。
十個軍事要塞司令部由以下組成：五十九個步兵營、四個空降步兵營、八個騎兵營、十一個野戰炮兵營、十個防空營、八個工程營、一個飛行中隊、一個直升機中隊、一個步兵旅。
特種部隊司令部則包含：兩個戰鬥作戰大隊、一個教育/訓練大隊、一個情報大隊、一個反恐怖大隊。
戰略預備部隊由以下組成：兩個步兵師司令部、三個步兵旅。下設九個步兵營、三個空降旅，下設九個空降營、兩個野戰跑兵團，下設六個炮兵營、一個防空炮兵團，下設兩個防空炮兵營、一個野戰工程團，下設兩個工程營。總人數大約有二十三點五萬人。其中包括了戰略預備司令部所屬人員。特種部隊人數六千人。步兵武器多數是自行製造的，而大多數重型武器則是進口的。
印尼空軍負責空中作戰、運輸以及訓練任務。盡管印尼陸軍和海軍都配有獨立的空中部隊，但空軍仍要執行陸軍近距離空中支援、海軍遠程偵察以及巡邏任務。印尼武裝部隊所有的飛行員都由印尼空軍進行培訓。以雅加達為界，印尼空中作戰指揮中心分為東、西兩個區域。最大地作戰司令部是koopsa，部設在蘇拉威西.con省的烏戌潘當，負責雅加達以東所有的空軍作戰任務。總部設在雅加達的koopsaui負責雅加達以西的空中作戰任務。總部設在雅加達的國家防空司令部。指揮國內所有地戰鬥機和反暴亂飛機。下屬有訓練司令部和物資司令部。
空軍包括以下組成：兩個地麵攻擊機中隊、一個攔截機中隊、兩個反暴亂中隊、一個海上偵察機中隊、四個運輸機中隊、三個直升機中隊、四個訓練中隊、五個機場防空營。兵力總人數約為兩萬一千人。
印尼海軍包括：一個總參謀部、兩個作戰艦隊司令部（分為東部和西部）、海上突擊隊、一個小型空軍部隊以及軍事海上補給司令部。自從一九五八年以來，印尼海軍擁有了一個小型空軍部隊。其總部設在泗水（surabaya），擁有幾個輕型飛機中隊、幾個運輸機中隊和直升機中隊，主要負責海軍的偵察和海岸線巡邏任務。海軍通信司令部和艦隊指揮司令部協同指揮海軍的後勤支援係統。訓練司令部負責艦隊訓練、技術訓練計劃，並管理相關機構。
印尼海軍突擊隊有兩個戰鬥步兵團，一個駐紮在雅加達，另一個駐紮在泗水。它們配備有輕型坦克、裝甲人員輸送車以及反艦炮。戰時，部分海軍突擊隊將由戰略預備部隊指揮。海軍突擊隊包括：兩個步兵團、六個步兵營、一個戰鬥支援團、一個炮兵營、一個防空營、一個行政支援團、一個訓練團、一特種部隊營。總兵力約為四萬三千人。其中包括海軍突擊隊一萬兩千人和海軍航空兵一千人。