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江北軍的反應非常快，然而袁世凱的反應更快，在袁世凱下令之後，清軍四路大軍重新調賬了部分軍隊與指揮官後，立即展開了對江北的軍事行動。清軍不缺人，不缺錢，不缺物資，可以這一次對江北軍的進攻集結了清軍最後的軍事力量以及外國勢力的強烈幹涉，但是在許多北洋軍看來，與洋人的合作並不算是賣國行為，他們是為了統一而暫時性的選擇借用其他勢力。
清軍的四路大軍，從四個方向朝兩個軍事目標前進。
清軍第一路為湖北馮國璋率領的北洋軍第三鎮、北洋軍第四鎮、北洋軍第六鎮第十一協、河湳新軍第二十九協、河湳各路巡防營0營，總計8萬餘人。馮國璋率軍從湖北進軍，先收複皖中，而後順江而下占領浦口，沿浦口占領鳳陽府，隨後進攻揚州，試圖包抄江北軍。
清軍第二路由靳雲鵬率領北洋軍第五鎮、山東新軍第四十七協、原駐防熱河的毅軍、原駐防灤州的北洋軍第二十鎮、山東各路巡防營10營，直隸巡防營10營，總兵力10萬人，沿津浦鐵路直撲徐州，占領徐州。
清軍第三路由王占元率領北洋軍第二鎮第三協、河湳各路巡防營10營、毅軍10營，總兵力萬人，由河湳向皖北發起進攻，從右側包抄江北軍徐州守軍。
清軍第四路由王廷楨率領禁衛軍與山東各路巡防營5營、八旗兵10營由海州（連雲港）發起進攻，總兵力萬人，試圖占領海州後從左路包抄徐州，將徹底占領徐州。
清軍四路大軍總計二十四萬人，其中北洋軍主力部隊高達十萬人，由此可見袁世凱非但蓄謀已久，且深知進攻江北軍必然要一鼓作氣將其消滅，絕不能給江北軍喘息之機。
四路大軍中，第一路進攻浦口之馮國璋部與第二路進攻徐州之馮國璋部才是主攻重點，而第三路和第四路皆為包抄之輔兵。
尤其是第四路的王廷楨部所帶領部隊皆為禁軍與八旗兵，而山東各路巡防營不過才五個營三千多人，且都是臨時征調，毫無戰意。不過第四路卻並非毫無戰鬥力，禁軍皆由滿漢蒙八旗子弟與回族青年組成，他們更加忠於朝廷，因此每年朝廷在他們身上花費的軍餉、配給的武器和裝備皆不遜於北洋六鎮，尤其是袁世凱還聘請了自己的日本顧問組成日本顧問團監督第四路，避免第四路厭戰心裏。起來好笑的是，袁世凱等清末漢人為了滿清江山拋頭顱灑熱血，反倒是滿人早早看透了清帝國遲早終結，不願意繼續保這個江山，因此禁軍與八旗軍戰意不高，袁世凱不得不讓日本顧問團督促八旗兵與禁軍，但效果顯然很差。
袁世凱發令之後，再一次與納爾遜爵士會晤，並秘密商討起辦法，他希望從四國銀行中借貸更多的錢，而為了對付王永安以及他的江北勢力，四國銀行承諾以五年的低息借給清政府5000萬兩白銀，專門用於對江北的戰爭之中。
與此同時，王永安也在於馮衡商議徐州的軍團與鳳陽府的軍團統帥的問題，由誰帶領徐州的四個江北陸軍師，誰又能指揮得動鳳陽府的四個江北陸軍師。