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揚州城內的百姓們有一些慌亂，但是在張謇和陳兆棠的調度安排之下，井井有序地向蘇北撤離，實際上他們更希望去蘇南地區，然而現在蘇南地區是革命黨的地盤，且革命黨尚未表態是否願意接受這些“難民”，再加上南方鬧革命的時候各方牛鬼蛇神並起，大軍閥坐擁地盤，其中少不得有人作奸犯科，給革命黨隊伍帶來了很嚴重的名譽影響。孫逸仙本來想花大力氣整治那些騷擾百姓的“革命分子”，可是一來他本身沒有軍隊，二來他想要治理作奸犯科者，卻拿不出理由。
作奸犯科者揚言，當初你老子我搏命帶著隊伍把滿清趕走的時候，你孫大炮還摟著日本娘們在美國到處騙錢呢，你現在當了臨時大總統了，就想一腳把老子給踢開，你做夢吧你！你想讓老子我老老實實不鬧事也行啊，你至少先得填飽老子和老子手下嗯的肚子吧，老子總不能推翻了滿清，然後餓死在南京城中吧？
缺錢，成了南方臨時革命政府最大的困難，所以孫逸仙隻得被迫從日本銀行借款，卻不被人理解。想日本人借錢的行為非但遭到了大部分人的反對，甚至還有人試圖有人發動兵變逼宮，在黃興的支持下，孫逸仙才鎮壓了兵變行為，而因為兵變的惡劣影響，孫逸仙最終勉強與日本借款，從日本人手中借來了伍佰萬日圓用於遣散士兵和政府開支，這才讓南方臨時革命政府平安地度過了幾個月。
然而孫逸仙這邊剛剛把從日本人手中借來的錢給手下分下去，沒想到那邊江北軍卻與日軍打了起來。
孫逸仙等南方革命黨非常尷尬，孫逸仙內心盡管支持江北方麵，可卻不能明示出來，否則得罪了日本人，一旦被人追討貸款，南方革命政府可拿出不前來。可是作為一個革命領袖，他此時更不可能支持日本方麵了，日本雖然要求他支持日軍，但孫逸仙還是明智地拒絕表態支持日本，因此此次中日衝突，孫逸仙與南方革命政府很是尷尬。
此時很多革命宿老都以個人名義通電支持江北政府，然而作為南方革命政府，官方媒體的態度一直變現得很謹慎。有報紙采訪孫逸仙，他對媒體謹慎地：“中日兩國一衣帶水，世代友好，我不希望戰爭持續。我願意作為雙方調解人，來調節雙方的戰爭，希望中日和平相處。”
孫逸仙和稀泥的做法雖然明哲保身，但卻不被人接受，蓋因為革命黨人本便是那種熱血衝動的人，尤其是很多革命青年都是愛國者和狂熱分子，至於某些打著革命旗號為自己討利益的人雖然有，卻並不是主流，因此孫逸仙的講話非但讓很多人很是鄙視，更甚者漸漸地，在南京政府中掀起了一股倒孫風波來。
宋教仁便公開表示對江北政府的支持，他公開表示，江北乃中國之江北，日本乃虎狼之國，野心勃勃，中國萬萬不可退讓。宋教仁的講話讓孫逸仙更加尷尬，也讓很多革命青年更加崇拜這位誌向遠大的革命先驅。
雖然南方革命政府的官方態度曖昧不清，但並非他們不支持江北方麵，甚至為了支持江北，南方革命政府在南北和談中做出了許多讓步。隻是南方革命政府做出的努力都是私下裏的支持，根本拿不到表麵上來，這才讓很多革命青年誤以為他們軟弱無能。