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真武山是道教全真派的聖地，但全國有很多真武山，不單宜賓獨有，但凡叫做真武山的地方，必然供奉真武大帝，而全國真武山獨以宜賓真武山為尊。為何宜賓真武山如此受到大家尊崇，蓋因為宜賓真武山的道教活動最早並且從未中斷。
相傳東漢順帝時，張良後人張道陵修道時路過真武山，見其山有仙山靈氣，為道家養性存神餐霞煉道之洞府，於是便在真武山定居下來上傳道。唐朝時，又有呂洞賓白在翠屏山練劍，夜宿真武山純陽洞。宋末楊道人於真武山中修煉，在鬱孤台發現仙草，食仙草而得白日升之道。
至明代時，川南地區有一支強大的蠻族名為都掌蠻，意思為像族，其部自稱都掌人。都掌蠻發展到了明代成化年間，都掌蠻已經獨大於川南山區各族，不再滿足居住山林，開始覬覦川北平原。
明成化元年，都掌蠻中的山都掌蠻部落在頭領率領下圍攻江安、合江等九個縣，明憲宗下令川軍征討蠻族。但四川巡撫汪浩主戰，四川都督芮城主招降，兩人意見並不統一，此時趙鐸在成都起義，汪浩率軍全力撲滅趙鐸農民起義軍，都督芮城便與山都掌蠻約定許諾都掌蠻政治地位，都掌蠻各部落首領可以入城做官，都掌蠻部落從山中移居到平原地帶生活。芮城廣受各蠻族部落歡迎，川南各都掌蠻部落紛紛邀請芮城並準備歸降。
然而汪浩消滅趙鐸起義軍後率軍入川南之後，將川南漢族百姓跪地哭泣，昔日殺我漢人之蠻族如今坐在縣衙裏成了縣太爺，我們有仇不能報，有家不能回。汪浩大怒，下令直接將城裏的都掌人係數殺死，至此，都掌蠻各部重新叛亂。
明成化元年十月，都掌蠻占領貴州，十一月進攻川北，汪浩率領明軍與都掌人相互攻殺大戰數十場。對蠻族而言，漢人軍隊與漢人百姓別無二致，因此每占領一座城便屠戮漢人，此舉引起了川人的極大仇恨，川人紛紛參軍，明軍日益強大，都掌人隻好返回川南山中，因此雙方反複攻殺仇恨日盛。
萬曆元年，萬曆皇帝派遣四川巡撫曾省吾調集川、滇、黔官兵一十四萬征討都掌蠻，準備徹底將那群在山中日日騷擾漢人的都掌蠻消滅。曾省吾和部將到真武山祈禱神仙護佑，據傳因為真武大帝托夢相助，曾省吾大敗都掌蠻。曾省吾為報真武大帝的大恩大德，下令命部將修建真武祠，改山名為真武山，並擴建了部分祠、堂、樓、閣。經過大規模的擴建和修建，真武山成了雲、貴、川三省道教文化傳播中心，在四川道教界亨有“北青城、南真武”美譽。
然而因為都掌人與漢人之間的仇恨極深，川滇黔三省漢人對都掌人恨之入骨，因此征討都掌蠻的過程不可謂不殘忍，川南都掌人被屠戮殆盡，甚至幼童嬰兒也全部殺死，使得都掌蠻成為了一段曆史，此後川南各族對漢人政權無不俯首稱臣，再無二心。明代秉承不與蠻夷妥協的外交政策，一些少數民族因不服漢人政權而被明軍滅絕，因此在明軍鐵血高壓下生存下來的少數民族都異常強大。其中都掌人不接受漢化，有語言無文字，都掌蠻各部始終無法如東北女真人一樣團結成為一個強大的武裝力量，因此不可避免被滅族。